Michael Lund Nielsen

Michael Lund Nielsen

Professor

ORCID: 0000-0002-0067-9039

Udgivelsesår:
Alle
1 - 122 ud af 122Pr. side: 500
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2024
  2. E-pub ahead of print

    A quantitative and site-specific atlas of the citrullinome reveals widespread existence of citrullination and insights into PADI4 substrates

    Stripp, Alexandra, Hendriks, Ivo Alexander, Elsborg, Jonas Damgaard, Buch-Larsen, Sara Charlotte, Nielsen, C. H., Terslev, L., Kirsch, Rebecca, Damgaard, D., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Lennartsson, Caroline Linnea Elin, Rykær, M., Jensen, Lars Juhl, Christophorou, M. A. & Nielsen, Michael Lund, 2024, (E-pub ahead of print) I: Nature Structural and Molecular Biology.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. E-pub ahead of print

    DNAJC9 prevents CENP-A mislocalization and chromosomal instability by maintaining the fidelity of histone supply chains

    Balachandra, V., Shrestha, R. L., Hammond, Colin, Lin, S., Hendriks, Ivo Alexander, Sethi, S. C., Chen, L., Sevilla, S., Caplen, N. J., Chari, R., Karpova, T. S., McKinnon, K., Todd, Matthew, Koparde, V., Cheng, K. C., Nielsen, Michael Lund, Groth, Anja & Basrai, M. A., 2024, (E-pub ahead of print) I: The EMBO Journal.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    VCF1 is a p97/VCP cofactor promoting recognition of ubiquitylated p97-UFD1-NPL4 substrates

    Mirsanaye, Ann Schirin, Hoffmann, Saskia, Weisser, Melanie, Mund, Andreas, Lopez Mendez, B., Typas, D., van den Boom, J., Benedict, Bente, Hendriks, Ivo Alexander, Nielsen, Michael Lund, Meyer, H., Duxin, Julien, Montoya, Guillermo & Mailand, Niels, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 2459.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. 2023
  6. Udgivet

    Characterising the RNA-binding protein atlas of the mammalian brain uncovers RBM5 misregulation in mouse models of Huntington's disease

    Mullari, M., Fossat, Nicolas Julien, Skotte, Niels Henning, Asenjo-Martinez, A., Humphreys, D. T., Bukh, Jens, Kirkeby, Agnete, Scheel, Troels Kasper Høyer & Nielsen, Michael Lund, 2023, I: Nature Communications. 14, 20 s., 4348.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Characterizing ADP-Ribosylation Sites Using Af1521 Enrichment Coupled to ETD-Based Mass Spectrometry

    Anagho, Holda Awah, Elsborg, Jonas Damgaard, Hendriks, Ivo Alexander, Buch-Larsen, Sara Charlotte & Nielsen, Michael Lund, 2023, Poly(ADP-Ribose) Polymerase: Methods and Protocols. Tulin, A. V. (red.). Humana Press, s. 251-270 (Methods in Molecular Biology, Bind 2609).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Characterizing citrullination by mass spectrometry-based proteomics

    Stripp, Alexandra, Hendriks, Ivo Alexander & Nielsen, Michael Lund, 2023, I: Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences. 378, 1890, 14 s., 20220237.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    DAXX adds a de novo H3.3K9me3 deposition pathway to the histone chaperone network

    Carraro, Massimo, Hendriks, Ivo Alexander, Hammond, Colin, Solis-Mezarino, V., Völker-Albert, M., Elsborg, Jonas Damgaard, Weisser, Melanie, Spanos, C., Montoya, Guillermo, Rappsilber, J., Imhof, A., Nielsen, Michael Lund & Groth, Anja, 2023, I: Molecular Cell. 83, 7, s. 1075-1092.e9 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    PARP14 is a PARP with both ADP-ribosyl transferase and hydrolase activities

    Đukić, N., Strømland, Ø., Elsborg, J. D., Munnur, D., Zhu, K., Schuller, M., Chatrin, C., Kar, P., Duma, L., Suyari, O., Rack, J. G. M., Baretić, D., Crudgington, D. R. K., Groslambert, J., Fowler, G., Wijngaarden, S., Prokhorova, E., Rehwinkel, J., Schüler, H., Filippov, D. V. & 5 flere, Sanyal, S., Ahel, D., Nielsen, Michael Lund, Smith, R. & Ahel, I., 2023, I: Science Advances. 9, 37, 19 s., eadi2687.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Profiling ubiquitin signalling with UBIMAX reveals DNA damage- and SCFβ-Trcp1-dependent ubiquitylation of the actin-organizing protein Dbn1

    S.Colding-Christensen, Camilla, Kakulidis, Ellen Sofia, Arroyo Gomez, Javier, Hendriks, Ivo Alexander, Arkinson, C., Fábián, Z., Gambus, A., Mailand, Niels, Duxin, Julien & Nielsen, Michael Lund, 2023, I: Nature Communications. 14, 19 s., 8293.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Regulation of Rad52-dependent replication fork recovery through serine ADP-ribosylation of PolD3

    Richards, F., Llorca-Cardenosa, M. J., Langton, J., Buch-Larsen, Sara Charlotte, Shamkhi, N. F., Sharma, A. B., Nielsen, Michael Lund & Lakin, N. D., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 14 s., 4310.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Serine ADP-ribosylation in Drosophila provides insights into the evolution of reversible ADP-ribosylation signalling

    Fontana, P., Buch-Larsen, Sara Charlotte, Suyari, O., Smith, R., Suskiewicz, M. J., Schützenhofer, K., Ariza, A., Rack, J. G. M., Nielsen, Michael Lund & Ahel, I., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 3200.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    The SUMO–NIP45 pathway processes toxic DNA catenanes to prevent mitotic failure

    Hertz, Emil Peter Thrane, Alonso de Vega, Ignacio, Kruse, Thomas, Wang, Y., Hendriks, Ivo Alexander, Bizard, A. H., Eugui-Anta, A., Hay, R. T., Nielsen, Michael Lund, Nilsson, Jakob, Hickson, Ian David & Mailand, Niels, 2023, I: Nature Structural and Molecular Biology. 30, s. 1303-1313

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Transient suppression of SUMOylation in embryonic stem cells generates embryo-like structures

    Cossec, J. C., Traboulsi, T., Sart, S., Loe-Mie, Y., Guthmann, M., Hendriks, Ivo Alexander, Theurillat, I., Nielsen, Michael Lund, Torres-Padilla, M. E., Baroud, C. N. & Dejean, A., 2023, I: Cell Reports. 42, 4, 27 s., 112380.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. 2022
  17. Udgivet

    ADP-ribosyltransferases, an update on function and nomenclature

    Lüscher, B., Ahel, I., Altmeyer, M., Ashworth, A., Bai, P., Chang, P., Cohen, M., Corda, D., Dantzer, F., Daugherty, M. D., Dawson, T. M., Dawson, V. L., Deindl, S., Fehr, A. R., Feijs, K. L. H., Filippov, D. V., Gagné, J. P., Grimaldi, G., Guettler, S., Hoch, N. C. & 27 flere, Hottiger, M. O., Korn, P., Kraus, W. L., Ladurner, A., Lehtiö, L., Leung, A. K. L., Lord, C. J., Mangerich, A., Matic, I., Matthews, J., Moldovan, G. L., Moss, J., Natoli, G., Nielsen, Michael Lund, Niepel, M., Nolte, F., Pascal, J., Paschal, B. M., Pawłowski, K., Poirier, G. G., Smith, S., Timinszky, G., Wang, Z. Q., Yélamos, J., Yu, X., Zaja, R. & Ziegler, M., 2022, I: FEBS Journal. 289, 23, s. 7399-7410

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    SCAI promotes error-free repair of DNA interstrand crosslinks via the Fanconi anemia pathway

    Schubert, Lisa, Hendriks, Ivo Alexander, Hertz, Emil Peter Thrane, Wu, Wei, Sellés Baiget, Selene, Hoffmann, Saskia, Bagge, Keerthana Stine Viswalingam, Gallina, I., Pentakota, S., Benedict, Bente, Johansen, Joachim, Apelt, K., Luijsterburg, M. S., Rasmussen, Simon, Lisby, Michael, Liu, Ying, Nielsen, Michael Lund, Mailand, Niels & Duxin, Julien, 2022, I: EMBO Reports. 23, 4, 20 s., e53639.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Waves of sumoylation support transcription dynamics during adipocyte differentiation

    Zhao, X., Hendriks, Ivo Alexander, Le Gras, S., Ye, T., Ramos-Alonso, L., Nguea P, A., Lien, G. F., Ghasemi, F., Klungland, A., Jost, B., Enserink, J. M., Nielsen, Michael Lund & Chymkowitch, P., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 3, s. 1351-1369 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. 2021
  21. Udgivet

    Applicability of Small-Molecule Inhibitors in the Study of Peptidyl Arginine Deiminase 2 (PAD2) and PAD4

    Martín Monreal, M. T., Stripp, Alexandra, Massarenti, Laura, Mondal, S., Šenolt, L., Ødum, Niels, Nielsen, Michael Lund, Thompson, P. R., Nielsen, Claus Henrik & Damgaard, D., 2021, I: Frontiers in Immunology. 12, 11 s., 716250.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Chemical genetics and proteome-wide site mapping reveal cysteine MARylation by PARP-7 on immune-relevant protein targets

    Rodriguez, K. M., Buch-Larsen, Sara Charlotte, Kirby, I. T., Siordia, I. R., Hutin, D., Rasmussen, M., Grant, D. M., David, L. L., Matthews, J., Nielsen, Michael Lund & Cohen, M. S., 2021, I: eLife. 10, 35 s., e60480.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    DNAJC9 integrates heat shock molecular chaperones into the histone chaperone network

    Hammond, Colin, Bao, H., Hendriks, Ivo Alexander, Carraro, Massimo, García-Nieto, A., Liu, Y., Reveron-Gomez, Nazaret, Spanos, C., Chen, L., Rappsilber, J., Nielsen, Michael Lund, Patel, D. J., Huang, H. & Groth, Anja, 2021, I: Molecular Cell. 81, 12, s. 2533-2548

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Identification of Protein Direct Interactome with Genetic Code Expansion and Search Engine OpenUaa

    Liu, C., Wu, T., Shu, X., Li, S., Wang, D. R., Wang, N., Zhou, R., Yang, H., Jiang, H., Hendriks, Ivo Alexander, Gong, P., Zhang, L., Nielsen, Michael Lund, Li, K., Wang, L. & Yang, B., 2021, I: Advanced Biology. 5, 3, 11 s., 2000308.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    MaxQuant. Live Enables Enhanced Selectivity and Identification of Peptides Modified by Endogenous SUMO and Ubiquitin

    Hendriks, Ivo Alexander, Akimov, V., Blagoev, B. & Nielsen, Michael Lund, 2021, I: Journal of Proteome Research. 20, 4, s. 2042-2055 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Mechanism and function of DNA replication-independent DNA-protein crosslink repair via the SUMO-RNF4 pathway

    Liu, Julio, Kühbacher, U., Larsen, N. B., Borgermann, N., Garvanska, Dimitriya Hristoforova, Hendriks, Ivo Alexander, Ackermann, Leena, Haahr, Peter Thorlund, Gallina, I., Guérillon, C., Branigan, E., Hay, R. T., Azuma, Y., Nielsen, Michael Lund, Duxin, Julien & Mailand, Niels, 2021, I: E M B O Journal. 40, 21 s., e107413.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Serine-linked PARP1 auto-modification controls PARP inhibitor response

    Prokhorova, E., Zobel, F., Smith, R., Zentout, S., Gibbs-Seymour, I., Schützenhofer, K., Peters, A., Groslambert, J., Zorzini, V., Agnew, T., Brognard, J., Nielsen, Michael Lund, Ahel, D., Huet, S., Suskiewicz, M. J. & Ahel, I., 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 12 s., 4055.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Site-specific phosphorylation of PSD-95 dynamically regulates the postsynaptic density as observed by phase separation

    Vistrup-Parry, M., Chen, X., Johansen, T. L., Bach, S., Buch-Larsen, Sara Charlotte, Bartling, Christian Reinhard Otto, Ma, C., Clemmensen, L. S., Nielsen, Michael Lund, Zhang, M. & Strømgaard, Kristian, 2021, I: iScience. 24, 11, 103268.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Temporal and site-specific adp-ribosylation dynamics upon different genotoxic stresses

    Buch-Larsen, Sara Charlotte, Stripp, Alexandra, Hendriks, Ivo Alexander & Nielsen, Michael Lund, 2021, I: Cells. 10, 11, 16 s., 2927.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    The regulatory landscape of the human HPF1-and ARH3-dependent ADP-ribosylome

    Hendriks, Ivo Alexander, Buch-Larsen, Sara Charlotte, Prokhorova, E., Elsborg, Jonas Damgaard, Stripp, Alexandra, Zhu, K., Ahel, D., Lukas, Claudia, Ahel, I. & Nielsen, Michael Lund, 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 16 s., 5893.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    The ubiquitin ligase RFWD3 is required for translesion DNA synthesis

    Gallina, I., Hendriks, Ivo Alexander, Hoffmann, Saskia, Larsen, N. B., Johansen, Joachim, S.Colding-Christensen, Camilla, Schubert, Lisa, Sellés Baiget, Selene, Fábián, Z., Kühbacher, U., Gao, A. O., Räschle, M., Rasmussen, Simon, Nielsen, Michael Lund, Mailand, Niels & Duxin, Julien, 2021, I: Molecular Cell. 81, 3, s. 442-458.e9 27 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    Unrestrained poly-ADP-ribosylation provides insights into chromatin regulation and human disease

    Prokhorova, E., Agnew, T., Wondisford, A. R., Tellier, M., Kaminski, N., Beijer, D., Holder, J., Groslambert, J., Suskiewicz, M. J., Zhu, K., Reber, J. M., Krassnig, S. C., Palazzo, L., Murphy, S., Nielsen, Michael Lund, Mangerich, A., Ahel, D., Baets, J., O'Sullivan, R. J. & Ahel, I., 2021, I: Molecular Cell. 81, 12, s. 2640-2655

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. 2020
  34. Udgivet

    Extensive SUMO Modification of Repressive Chromatin Factors Distinguishes Pluripotent from Somatic Cells

    Theurillat, I., Hendriks, Ivo Alexander, Cossec, J., Andrieux, A., Nielsen, Michael Lund & Dejean, A., 2020, I: Cell Reports. 32, 11, 20 s., 108146.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    Mapping Physiological ADP-Ribosylation Using Activated Ion Electron Transfer Dissociation

    Buch-Larsen, Sara Charlotte, Hendriks, Ivo Alexander, Lodge, J. M., Rykaer, M., Furtwängler, Benjamin, Shishkova, E., Westphall, M. S., Coon, J. J. & Nielsen, Michael Lund, 2020, I: Cell Reports. 32, 12, 17 s., 108176.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    Multisite SUMOylation restrains DNA polymerase η interactions with DNA damage sites

    Guerillon, Claire Aline, Smedegaard, S., Hendriks, Ivo Alexander, Nielsen, Michael Lund & Mailand, Niels, 2020, I: Journal of Biological Chemistry. 295, s. 8350-8362

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Treacle controls the nucleolar response to rDNA breaks via TOPBP1 recruitment and ATR activation

    Mooser, C., Symeonidou, I., Leimbacher, P., Ribeiro, A., Shorrocks, A. K., Jungmichel, S., Buch-Larsen, Sara Charlotte, Knechtle, K., Jasrotia, A., Zurbriggen, D., Jeanrenaud, A., Leikauf, C., Fink, D., Nielsen, Michael Lund, Blackford, A. N. & Stucki, M., 2020, I: Nature Communications. 11, 16 s., 123.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. 2019
  39. Udgivet

    An advanced strategy for comprehensive profiling of ADP-ribosylation sites using mass spectrometry-based proteomics

    Hendriks, Ivo Alexander, Buch-Larsen, Sara Charlotte & Nielsen, Michael Lund, 2019, I: Molecular and Cellular Proteomics. 18, 5, s. 1010-1026

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    Citrullination of HP1γ chromodomain affects association with chromatin

    Wiese, M., Bannister, A. J., Basu, S., Boucher, W., Wohlfahrt, K., Christophorou, M. A., Nielsen, Michael Lund, Klenerman, D., Laue, E. D. & Kouzarides, T., 2019, I: Epigenetics & Chromatin. 12, 17 s., 21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Interaction of Sox2 with RNA binding proteins in mouse embryonic stem cells

    Samudyata, Amaral, P. P., Engström, P. G., Robson, S. C., Nielsen, Michael Lund, Kouzarides, T. & Castelo-Branco, G., 2019, I: Experimental Cell Research. 381, 1, s. 129-138 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    PAD2-Mediated Citrullination Contributes to Efficient Oligodendrocyte Differentiation and Myelination

    Falcão, A. M., Meijer, M., Scaglione, A., Rinwa, P., Agirre, E., Liang, J., Buch-Larsen, Sara Charlotte, Heskol, A., Frawley, R., Klingener, M., Varas-Godoy, M., Raposo, A. A. S. F., Ernfors, P., Castro, D. S., Nielsen, Michael Lund, Casaccia, P. & Castelo-Branco, G., 2019, I: Cell Reports. 27, 4, s. 1090-1102.e10

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Udgivet

    Regulation of GLI1 by cis DNA elements and epigenetic marks

    Taylor, R., Long, J., Yoon, J. W., Childs, R., Sylvestersen, K. B., Nielsen, Michael Lund, Leong, K., Iannaccone, S., Walterhouse, D. O., Robbins, D. J. & Iannaccone, P., 2019, I: DNA Repair. 79, s. 10-21 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    SUMOylation promotes protective responses to DNA-protein crosslinks

    Borgermann, N., Ackermann, Leena, Schwertman, P., Hendriks, Ivo Alexander, Thijssen, K., Liu, Julio, Lans, H., Nielsen, Michael Lund & Mailand, Niels, 2019, I: E M B O Journal. 38, 17 s., e101496.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. 2018
  46. Udgivet

    Arginine Methylation by PRMT2 Controls the Functions of the Actin Nucleator Cobl

    Hou, W., Nemitz, S., Schopper, S., Nielsen, Michael Lund, Kessels, M. M. & Qualmann, B., 2018, I: Developmental Cell. 45, 2, s. 262-275.E8

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. Udgivet

    Integrative Characterization of the R6/2 Mouse Model of Huntington's Disease Reveals Dysfunctional Astrocyte Metabolism

    Skotte, Niels Henning, Andersen, Jens Velde, Santos, A., Aldana, Blanca, Willert, C. W., Nørremølle, Anne, Waagepetersen, Helle S. & Nielsen, Michael Lund, 2018, I: Cell Reports. 23, 7, s. 2211-2224 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Site-specific characterization of endogenous SUMOylation across species and organs

    Hendriks, Ivo Alexander, Lyon, D., Su, D., Skotte, Niels Henning, Daniel, J. A., Jensen, Lars Juhl & Nielsen, Michael Lund, 2018, I: Nature Communications. 9, s. 1-17 2456.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Systems-wide Analysis of Serine ADP-Ribosylation Reveals Widespread Occurrence and Site-Specific Overlap with Phosphorylation

    Buch-Larsen, Sara Charlotte, Hendriks, Ivo Alexander, Lyon, D., Jensen, Lars Juhl & Nielsen, Michael Lund, 2018, I: Cell Reports. 24, 9, s. 2493-2505

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. 2017
  51. Udgivet

    Bub1 positions Mad1 close to KNL1 MELT repeats to promote checkpoint signalling

    Zhang, G., Kruse, Thomas, López-Méndez, B., Sylvestersen, K. B., Garvanska, Dimitriya Hristoforova, Schopper, S., Nielsen, Michael Lund & Nilsson, Jakob, 12 jun. 2017, I: Nature Communications. 8, 12 s., 15822.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  52. Udgivet

    Improved Reversed Phase Chromatography of Hydrophilic Peptides from Spatial and Temporal Changes in Column Temperature

    Young, C., Podtelejnikov, A. V. & Nielsen, Michael Lund, 2 jun. 2017, I: Journal of Proteome Research. 16, 6, s. 2307-2317 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  53. Udgivet

    Site-specific mapping of the human SUMO proteome reveals co-modification with phosphorylation

    Hendriks, Ivo Alexander, Lyon, D., Young, C., Jensen, Lars Juhl, Vertegaal, A. C. O. & Nielsen, Michael Lund, mar. 2017, I: Nature Structural and Molecular Biology. 24, 3, s. 325-336 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  54. Udgivet

    An Optimized Shotgun Strategy for the Rapid Generation of Comprehensive Human Proteomes

    Bekker-Jensen, D. B., Kelstrup, C. D., Batth, Tanveer Singh, Buch-Larsen, Sara Charlotte, Haldrup, C., Bramsen, J. B., Sørensen, K. D., Høyer, S., Ørntoft, T. F., Andersen, C. L., Nielsen, Michael Lund & Olsen, Jesper Velgaard, 2017, I: Cell Systems. 4, 6, s. 587-599, e1-e4 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. Udgivet

    Citrullination modulates oligodendrocyte differentiation

    Falcao, A., Meijer, M., Rinwa, P., Cummings, T., Varas, M., Liang, J., Casaccia, P., Christophorou, M., Nielsen, Michael Lund, Ernfors, P. & Castelo-Branco, G., 2017, I: Glia. 65, S1, s. E389 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

  56. Udgivet

    Proteome-Wide Identification of In Vivo ADP-Ribose Acceptor Sites by Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry

    Buch-Larsen, Sara Charlotte, Leutert, M., Bilan, V., Martello, R., Jungmichel, S., Young, C., Hottiger, M. O. & Nielsen, Michael Lund, 2017, Poly(ADP-Ribose) Polymerase. Tulin, A. V. (red.). Humana Press, Bind 1608. s. 149-162 14 s. (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  57. Udgivet

    Specifying RNA-Binding Regions in Proteins by Peptide Cross-Linking and Affinity Purification

    Mullari, M., Lyon, D., Jensen, Lars Juhl & Nielsen, Michael Lund, 2017, I: Journal of Proteome Research. 16, 8, s. 2762-2772 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  58. 2016
  59. Udgivet

    Proteome-wide identification of the endogenous ADP-ribosylome of mammalian cells and tissue

    Martello, R., Leutert, M., Jungmichel, S., Bilan, V., Buch-Larsen, Sara Charlotte, Young, C., Hottiger, M. O. & Nielsen, Michael Lund, 1 okt. 2016, I: Nature Communications. 7, 13 s., 12917.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  60. Udgivet

    Proteome-wide analysis of arginine monomethylation reveals widespread occurrence in human cells

    Buch-Larsen, Sara Charlotte, Sylvestersen, K. B., Mund, Andreas, Lyon, D., Mullari, M., Madsen, M. V., Daniel, J. A., Jensen, Lars Juhl & Nielsen, Michael Lund, 30 aug. 2016, I: Science Signaling. 9, 443, 14 s., rs9.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  61. 2015
  62. Udgivet

    Large-Scale Identification of the Arginine Methylome by Mass Spectrometry

    Sylvestersen, K. B. & Nielsen, Michael Lund, 2 nov. 2015, Current Protocols in Protein Science. Bind 82. 17 s. (Current Protocols in Protein Science).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  63. Udgivet

    Liquid demixing of intrinsically disordered proteins is seeded by poly(ADP-ribose)

    Altmeyer, M., Neelsen, K. J., Teloni, F., Pozdnyakova, I., Pellegrino, S., Grøfte, M., Rask, M. D., Streicher, W., Jungmichel, S., Nielsen, Michael Lund & Lukas, Jiri, 19 aug. 2015, I: Nature Communications. 6, s. 1-12 8088.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  64. Udgivet

    A two-step protein quality control pathway for a misfolded DJ-1 variant in fission yeast

    Mathiassen, S. G., Larsen, I. B., Poulsen, E. G., Madsen, C. T., Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten, Kragelund, Birthe Brandt, Nielsen, Michael Lund, Kriegenburg, F. & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2015, I: The Journal of Biological Chemistry. 290, 34, s. 21141-21153 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  65. Udgivet

    Biotin starvation causes mitochondrial protein hyperacetylation and partial rescue by the SIRT3-like deacetylase Hst4p

    Madsen, C. T., Sylvestersen, K. B., Young, C., Buch-Larsen, Sara Charlotte, Poulsen, J. W., Andersen, M. A., Palmqvist, E. A., Hey-Mogensen, M., Jensen, P. B., Treebak, Jonas Thue, Lisby, Michael & Nielsen, Michael Lund, 2015, I: Nature Communications. 6, 12 s., 7726.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  66. Udgivet

    Direct neuronal glucose uptake Heralds activity-dependent increases in cerebral metabolism

    Lundgaard, I., Li, B., Xie, L., Kang, H., Sanggaard, S., Haswell, J. D. R., Sun, W., Goldman, S., Blekot, S., Nielsen, Michael Lund, Takano, T., Deane, R. & Nedergaard, Maiken, 2015, I: Nature Communications. 6, 12 s., 6807.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  67. 2014
  68. Udgivet

    The NBS1-Treacle complex controls ribosomal RNA transcription in response to DNA damage

    Larsen, D. H., Hari, F., Clapperton, J. A., Gwerder, M., Gutsche, K., Altmeyer, M., Jungmichel, S., Toledo Lazaro, L. I., Fink, D., Rask, M., Grøfte, M., Lukas, Claudia, Nielsen, Michael Lund, Smerdon, S. J., Lukas, Jiri & Stucki, M., aug. 2014, I: Nature Cell Biology. 16, 8, s. 792-803 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  69. Udgivet

    Analytical utility of mass spectral binning in proteomic experiments by SPectral Immonium Ion Detection (SPIID)

    Kelstrup, C. D., Freese, C., Heck, A. J. R., Olsen, Jesper Velgaard & Nielsen, Michael Lund, 3 jun. 2014, I: Molecular & Cellular Proteomics. 13, 8, s. 1914-1924 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  70. Udgivet

    Citrullination regulates pluripotency and histone H1 binding to chromatin

    Christophorou, M. A., Castelo-Branco, G., Halley-Stott, R. P., Oliveira, C. S., Loos, R., Radzisheuskaya, A., Mowen, K. A., Bertone, P., Silva, J. C. R., Zernicka-Goetz, M., Nielsen, Michael Lund, Gurdon, J. B. & Kouzarides, T., 6 mar. 2014, I: Nature. 507, s. 104-108

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  71. Udgivet

    Proteomic analysis of arginine methylation sites in human cells reveals dynamic regulation during transcriptional arrest

    Sylvestersen, K. B., Horn, H., Jungmichel, S., Jensen, Lars Juhl & Nielsen, Michael Lund, 21 feb. 2014, I: Molecular & Cellular Proteomics. 13, s. 2072-2088 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  72. Udgivet

    Specificity and commonality of the phosphoinositide-binding proteome analyzed by quantitative mass spectrometry

    Jungmichel, S., Sylvestersen, K. B., Choudhary, Chunaram, Nguyen, S., Mann, Matthias & Nielsen, Michael Lund, 13 feb. 2014, I: Cell Reports. 6, 3, s. 578-91 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  73. Udgivet

    Protein Interaction Screening for the Ankyrin Repeats and Suppressor of Cytokine Signaling (SOCS) Box (ASB) Family Identify Asb11 as a Novel Endoplasmic Reticulum Resident Ubiquitin Ligase

    Andresen, C. A., Smedegaard, S., Sylvestersen, K. B., Svensson, C., Iglesias Gato, Diego, Cazzamali, G., Nielsen, T. K., Nielsen, Michael Lund & Flores Morales, A., 24 jan. 2014, I: The Journal of Biological Chemistry. 289, 4, s. 2043-2054 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  74. Udgivet

    Glutamine methylation in histone H2A is an RNA-polymerase-I-dedicated modification

    Tessarz, P., Santos-Rosa, H., Robson, S. C., Sylvestersen, K. B., Nelson, C. J., Nielsen, Michael Lund & Kouzarides, T., 23 jan. 2014, I: Nature. 505, s. 564-568

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  75. Udgivet

    Tousled-like kinases phosphorylate Asf1 to promote histone supply during DNA replication

    Kamalyukova, I. M., Young, C., Strømme, C. B., Ménard, Patrice, Jasencakova, Zuzana, Mejlvang, J., Ask, K., Ploug, Michael, Nielsen, Michael Lund, Jensen, O. N. & Groth, Anja, 2014, I: Nature Communications. 5, s. 3394

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  76. 2013
  77. Udgivet

    Proteome-wide Identification of Poly(ADP-Ribosyl)ation Targets in Different Genotoxic Stress Responses

    Jungmichel, S., Rosenthal, F., Altmeyer, M., Lukas, Jiri, Hottiger, M. O. & Nielsen, Michael Lund, 24 okt. 2013, I: Molecular Cell. 52, 2, s. 272-285 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  78. Udgivet

    A new cellular stress response that triggers centriolar satellite reorganization and ciliogenesis

    Villumsen, B. H., Danielsen, J. R., Povlsen, L., Sylvestersen, K. B., Merdes, A., Beli, P., Yang, Y., Choudhary, Chunaram, Nielsen, Michael Lund, Mailand, Niels & Bekker-Jensen, Simon Holst, 11 okt. 2013, I: E M B O Journal. 32, 23, s. 3029-3040

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  79. Udgivet

    CDK-mediated activation of the SCF(FBXO) (28) ubiquitin ligase promotes MYC-driven transcription and tumourigenesis and predicts poor survival in breast cancer

    Cepeda, D., Ng, H-F., Sharifi, H. R., Mahmoudi, S., Cerrato, V. S., Fredlund, E., Magnusson, K., Nilsson, H., Malyukova, A., Rantala, J., Klevebring, D., Viñals, F., Bhaskaran, N., Zakaria, S. M., Rahmanto, A. S., Grotegut, S., Nielsen, M. L., Szigyarto, C. A-K., Sun, D., Lerner, M. & 10 flere, Navani, S., Widschwendter, M., Uhlén, M., Jirström, K., Pontén, F., Wohlschlegel, J., Grandér, D., Spruck, C., Larsson, L. & Sangfelt, O., 3 jul. 2013, I: E M B O Molecular Medicine (Online). 5, 7, s. 1067-1086 20 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  80. Udgivet

    Advances in characterizing ubiquitylation sites by mass spectrometry

    Sylvestersen, K. B., Young, C. & Nielsen, Michael Lund, 5 jan. 2013, I: Current Opinion in Chemical Biology. 17, 1, s. 49-58 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  81. Udgivet

    Effectiveness of a coordinated and tailored return-to-work intervention for sickness absence beneficiaries with mental health problems

    Martin, M., Nielsen, Michael Lund, Madsen, I., Petersen, S., Lange, Theis & Rugulies, R., 2013, I: Journal of Occupational Rehabilitation. 23, 4, s. 621-30 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  82. Udgivet

    Novel serological neo-epitope markers of extracellular matrix proteins for the detection of portal hypertension

    Leeming, D. J., Karsdal, M. A., Byrjalsen, I., Bendtsen, Flemming, Trebicka, J., Nielsen, Michael Lund, Christiansen, C., Møller, Søren & Krag, A., 2013, I: Alimentary Pharmacology and Therapeutics. 38, 9, s. 1086-1096 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  83. Udgivet

    RNA-DNA sequence differences spell genetic code ambiguities

    Bentin, Thomas & Nielsen, Michael Lund, 2013, I: Artificial DNA. 2, 3, s. 69-70 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  84. Udgivet

    Using guanidine-hydrochloride for fast and efficient protein digestion and single-step affinity-purification mass spectrometry

    Poulsen, J. W., Madsen, C. T., Young, C., Poulsen, F. M. & Nielsen, Michael Lund, 2013, I: Journal of Proteome Research. 12, 2, s. 1020-30 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  85. 2012
  86. Udgivet

    Systems-wide analysis of ubiquitylation dynamics reveals a key role for PAF15 ubiquitylation in DNA-damage bypass

    Povlsen, L. K., Beli, P., Wagner, S. A., Poulsen, S. L., Sylvestersen, K. B., Poulsen, J. W., Nielsen, Michael Lund, Bekker-Jensen, Simon Holst, Mailand, Niels & Choudhary, Chunaram, okt. 2012, I: Nature Cell Biology. 14, 10, s. 1089-98 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  87. Udgivet

    The molecular basis of ATM-dependent dimerization of the Mdc1 DNA damage checkpoint mediator.

    Jungmichel, S., Clapperton, J. A., Janette, L., Hari, F. J., Spycher, C., Pavic, L., Li, J., Haire, L. F., Bonalli, M., Larsen, D. H., Lukas, C., Lukas, J., MacMillan, D., Nielsen, Michael Lund, Stucki, M. & Smerdon, S. J., 10 jan. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 9, s. 4913-4928 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  88. Udgivet

    Self-hydroxylation of the splicing factor lysyl hydroxylase, JMJD6

    Mantri, M., Webby, C. J., Loik, N. D., Hamed, R. B., McDonough, M. A., McCullagh, J. S. O., Schofield, C. J., Wolf, A., Nielsen, Michael Lund & Böttger, A., 1 jan. 2012, I: MedChemComm. 3, 1, s. 80-85 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  89. Udgivet

    Comprehensive profiling of proteome changes upon sequential deletion of deubiquitylating enzymes

    Poulsen, J. W., Madsen, C. T., Young, C., Kelstrup, C. D., Grell, H. C., Henriksen, P., Jensen, Lars Juhl & Nielsen, Michael Lund, 2012, I: Journal of Proteomics. 75, 13, s. 3886-97 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  90. Udgivet

    Optimized Fast and Sensitive Acquisition Methods for Shotgun Proteomics on a Quadrupole Orbitrap Mass Spectrometer

    Kelstrup, C. D., Young, C., Lavallee, R., Nielsen, Michael Lund & Olsen, Jesper Velgaard, 2012, I: Journal of Proteome Research. s. 3487-3497 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  91. Udgivet

    Pdx1 is post-translationally modified in vivo and serine 61 is the principal site of phosphorylation

    Frogne, T., Sylvestersen, K. B., Kubicek, S., Nielsen, Michael Lund & Hecksher-Sørensen, J., 2012, I: P L o S One. 7, 4, s. e35233

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  92. Udgivet

    Proteomic analyses reveal divergent ubiquitylation site patterns in murinetissues

    Wagner, S. A., Beli, P., Weinert, B. T., Schölz, C. F., Kelstrup, C. D., Young, C., Nielsen, Michael Lund, Olsen, Jesper Velgaard, Brakebusch, Cord Herbert & Choudhary, Chunaram, 2012, I: Molecular & Cellular Proteomics.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  93. 2011
  94. Udgivet

    A Proteome-wide, Quantitative Survey of In Vivo Ubiquitylation Sites Reveals Widespread Regulatory Roles

    Wagner, S. A., Beli, P., Weinert, B. T., Nielsen, Michael Lund, Cox, J., Mann, Matthias & Choudhary, Chunaram, 1 okt. 2011, I: Molecular and Cellular Proteomics. 10, 10, s. M111.013284

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  95. Udgivet

    Mass spectrometric analysis of lysine ubiquitylation reveals promiscuity at site level

    Danielsen, J. M. R., Sylvestersen, K. B., Bekker-Jensen, Simon Holst, Szklarczyk, D., Poulsen, J. W., Horn, H., Jensen, Lars Juhl, Mailand, Niels & Nielsen, Michael Lund, 1 mar. 2011, I: Molecular and Cellular Proteomics. 10, 3, s. M110.003590

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  96. Udgivet

    The SOCS2 Ubiquitin Ligase Complex Regulates Growth Hormone Receptor Levels

    Vesterlund, M., Zadjali, F., Persson, T., Nielsen, Michael Lund, Kessler, B. M., Norstedt, G. & Flores Morales, A., 1 jan. 2011, I: P L o S One. 6, 9, s. e25358 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  97. ATP Enhances Neuronal Differentiation of PC12 Cells by Activating PKC alpha Interactions with Cytoskeletal Proteins

    Marin-Vicente, C., Guerrero-Valero, M., Nielsen, Michael Lund, Savitski, M. M., Gomez-Fernandez, J. C., Zubarev, R. A. & Corbalan-Garcia, S., 2011, I: Journal of Proteome Research. 10, 2, s. 529-540 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  98. 2009

  99. A dual pressure linear ion trap orbitrap instrument with very high sequencing speed

    Olsen, Jesper Velgaard, Schwartz, J. C., Griep-Raming, J., Nielsen, Michael Lund, Damoc, E., Denisov, E., Lange, O., Remes, P., Taylor, D., Splendore, M., Wouters, E. R., Senko, M., Makarov, A., Mann, Matthias & Horning, S., 2009, I: Molecular and Cellular Proteomics. 8, 12, s. 2759-69 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  100. Analysis of in vivo histone methylation kinetics by Heavy Methyl SILAC

    Bonaldi, T., Vitale, E., Nielsen, Michael Lund, Cox, J. & Mann, M., 2009, I: Amino Acids. 37, s. 66 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  101. Jmjd6 Catalyses Lysyl-Hydroxylation of U2AF65, a Protein Associated with RNA Splicing

    Webby, C. J., Wolf, A., Gromak, N., Dreger, M., Kramer, H., Kessler, B., Nielsen, Michael Lund, Schmitz, C., Butler, D. S., Yates, J. R., Delahunty, C. M., Hahn, P., Lengeling, A., Mann, M., Proudfoot, N. J., Schofield, C. J. & Boettger, A., 2009, I: Science. 325, 5936, s. 90-93 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  102. Udgivet

    Lysine acetylation targets protein complexes and co-regulates major cellular functions

    Choudhary, Chunaram, Kumar, C., Gnad, F., Nielsen, Michael Lund, Rehman, M., Walther, T. C., Olsen, Jesper Velgaard & Mann, Matthias, 2009, I: Science. 325, 5942, s. 834-40 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  103. 2008

  104. Analytical Utility of Small Neutral Losses from Reduced Species in Electron Capture Dissociation Studied Using SwedECD Database

    Falth, M., Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund, Kjeldsen, F., Andren, P. E. & Zubarev, R. A., 2008, I: Analytical Chemistry. 80, 21, s. 8089-8094 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  105. Comprehensive mass-spectrometry-based proteome quantification of haploid versus diploid yeast

    de Godoy, L. M. F., Olsen, J. V., Cox, J., Nielsen, Michael Lund, Hubner, N. C., Fröhlich, F., Walther, T. C. & Mann, M., 2008, I: Nature. 455, 7217, s. 1251-4 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  106. Identification of dominant signaling pathways from proteomics expression data

    Zubarev, R. A., Nielsen, Michael Lund, Fung, E. M., Savitski, M. M., Kel-Margoulis, O., Wingender, E. & Kel, A., 2008, I: Journal of Proteomics. 71, 1, s. 89-96 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  107. Immunoaffinity enrichments followed by mass spectrometric detection for studying global protein tyrosine phosphorylation

    Lind, S. B., Molin, M., Savitski, M. M., Emilsson, L., Astrom, J., Hedberg, L., Adams, C., Nielsen, Michael Lund, Engstrom, A., Elfineh, L., Andersson, E., Zubarev, R. A. & Pettersson, U., 2008, I: Journal of Proteome Research. 7, 7, s. 2897-2910 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  108. Iodoacetamide-induced artifact mimics ubiquitination in mass spectrometry

    Nielsen, Michael Lund, Vermeulen, M., Bonaldi, T., Cox, J., Moroder, L. & Mann, M., 2008, I: Nature Methods. 5, 6, s. 459-460 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  109. 2007

  110. Backbone carbonyl group basicities are related to gas-phase fragmentation of peptides and protein folding

    Savitski, M. M., Kjeldsen, F., Nielsen, Michael Lund, Garbuzynskiy, S. O., Galzitskaya, O. V., Surin, A. K. & Zubarev, R. A., 2007, I: Angewandte Chemie International Edition. 46, 9, s. 1481-1484 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  111. De novo peptide sequencing and identification with precision mass spectrometry

    Frank, A. M., Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund, Zubarev, R. A. & Pevzner, P. A., 2007, I: Journal of Proteome Research. 6, 1, s. 114-123 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  112. Electrospray ionization tandem mass spectrometry sequencing of novel skin peptides from Ranid frogs containing disulfide bridges

    Samgina, T., Arternenko, K., Gorshkov, V., Lebedev, A., Nielsen, Michael Lund, Savitski, M. & Zubarev, R., 2007, I: European Journal of Mass Spectrometry. 13, 2, s. 155-163 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  113. Hydrogen rearrangement to and from radical z fragments in electron capture dissociation of peptides

    Savitski, M. M., Kjeldsen, F., Nielsen, Michael Lund & Zubarev, R. A., 2007, I: Journal of The American Society for Mass Spectrometry. 18, 1, s. 113-120 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  114. On studying protein phosphorylation patterns using bottom-up LC-MS/MS: the case of human alpha-casein

    Kjeldsen, F., Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund, Shi, L. & Zubarev, R. A., 2007, I: Analyst. 132, 8, s. 768-776 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  115. Relative specificities of water and ammonia losses from backbone fragments in collision-activated dissociation

    Savitski, M. M., Kjeldsen, F., Nielsen, Michael Lund & Zubarev, R. A., 2007, I: Journal of Proteome Research. 6, 7, s. 2669-2673 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  116. Side-chain losses in electron capture dissociation to improve peptide identification

    Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund & Zubarev, R. A., 2007, I: Analytical Chemistry. 79, 6, s. 2296-2302 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  117. SwedCAD, a database of annotated high-mass accuracy MS/MS spectra of tryptic peptides

    Falth, M., Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund, Kjeldsen, F., Andren, P. E. & Zubarev, R. A., 2007, I: Journal of Proteome Research. 6, 10, s. 4063-4067 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  118. The RBCC gene RFP2 (leu5) encodes a novel transmembrane E3 ubiquitin ligase involved in ERAD

    Lerner, M., Corcoran, M., Cepeda, D., Nielsen, Michael Lund, Zubarev, R., Ponten, F., Uhlen, M., Hober, S., Grander, D. & Sangfelt, O., 2007, I: Molecular Biology of the Cell. 18, 5, s. 1670-1682 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  119. 2006

  120. Complementary sequence preferences of electron-capture dissociation and vibrational excitation in fragmentation of polypeptide polycations

    Savitski, M. M., Kjeldsen, F., Nielsen, Michael Lund & Zubarev, R. A., 2006, I: Angewandte Chemie International Edition. 45, 32, s. 5301-5303 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  121. Extent of modifications in human proteome samples and their effect on dynamic range of analysis in shotgun proteomics

    Nielsen, Michael Lund, Savitski, M. M. & Zubarev, R. A., 2006, I: Molecular and Cellular Proteomics. 5, 12, s. 2384-2391 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  122. Liquid chromatography at critical conditions: Comprehensive approach to sequence-dependent retention time prediction

    Gorshkov, A. V., Tarasova, I. A., Evreinov, V. V., Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund, Zubarev, R. A. & Gorshkov, M. V., 2006, I: Analytical Chemistry. 78, 22, s. 7770-7777 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  123. ModifiComb, a new proteomic tool for mapping substoichiometric post-translational modifications, finding novel types of modifications, and fingerprinting complex protein mixtures

    Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund & Zubarev, R. A., 2006, I: Molecular and Cellular Proteomics. 5, 5, s. 935-948 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  124. PhosTShunter: A fast and reliable tool to detect phosphorylated peptides in liquid chromatography Fourier transform tandem mass spectrometry data sets

    Kocher, T., Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund & Zubarev, R. A., 2006, I: Journal of Proteome Research. 5, 3, s. 659-668 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  125. 2005

  126. Improving protein identification using complementary fragmentation techniques in Fourier transform mass spectrometry

    Nielsen, Michael Lund, Savitski, M. M. & Zubarev, R. A., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 6, s. 835-845 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  127. New data base-independent, sequence tag-based scoring of peptide MS/MS data validates Mowse scores, recovers below threshold data, singles out modified peptides, and assesses the quality of MS/MS techniques

    Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund & Zubarev, R. A., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 8, s. 1180-1188 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  128. Proteomics-grade de novo sequencing approach

    Savitski, M. M., Nielsen, Michael Lund, Kjeldsen, F. & Zubarev, R. A., 2005, I: Journal of Proteome Research. 4, 6, s. 2348-2354 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  129. Toward error-free proteomics

    Zubarev, R., Nielsen, Michael Lund, Savitski, M. & Kocher, T., 2005, I: Molecular and Cellular Proteomics. 4, 8, s. S16-S16

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  130. 2004

  131. HysTag--a novel proteomic quantification tool applied to differential display analysis of membrane proteins from distinct areas of mouse brain

    Olsen, Jesper Velgaard, Andersen, J. R., Nielsen, P. A., Nielsen, Michael Lund, Figeys, D., Mann, Matthias & Wisniewski, J. R., jan. 2004, I: Molecular and Cellular Proteomics. 3, 1, s. 82-92 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  132. Physicochemical properties determining the detection probability of tryptic peptides in Fourier transform mass spectrometry. A correlation study

    Nielsen, Michael Lund, Savitski, M. M., Kjeldsen, F. & Zubarev, R. A., 2004, I: Analytical Chemistry. 76, 19, s. 5872-5877 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  133. Shifted-basis technique improves accuracy of peak position determination in Fourier transform mass spectrometry

    Savitski, M. M., Ivonin, I. A., Nielsen, Michael Lund, Zubarev, R. A., Tsybin, Y. O. & Hakansson, P., 2004, I: Journal of The American Society for Mass Spectrometry. 15, 4, s. 457-461 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  134. 2003

  135. Experiences and perspectives of MALDI MS and MS/MS in proteomic research

    Rappsilber, J., Moniatte, M., Nielsen, Michael Lund, Podtelejnikov, A. V. & Mann, M., 2003, I: International Journal of Mass Spectrometry. 226, 1, s. 223-237 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  136. Tandem MALDI/El ionization for tandem Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry of polypeptides

    Nielsen, Michael Lund, Budnik, B. A., Haselmann, K. F. & Zubarev, R. A., 2003, I: International Journal of Mass Spectrometry. 226, 1, s. 181-187 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  137. 2002

  138. Can relative cleavage frequencies in peptides provide additional sequence information?

    Budnik, B. A., Nielsen, Michael Lund, Olsen, Jesper Velgaard, Haselmann, K. F., Horth, P., Haehnel, W. & Zubarev, R. A., 2002, I: International Journal of Mass Spectrometry. 219, 1, s. 283-294 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  139. Electronic excitation gives informative fragmentation of polypeptide cations and anions

    Haselmann, K. F., Budnik, B. A., Kjeldsen, F., Nielsen, Michael Lund, Olsen, Jesper Velgaard & Zubarev, R. A., 2002, I: European Journal of Mass Spectrometry. 8, 2, s. 117-121 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  140. Peptide end sequencing by orthogonal MALDI tandem mass spectrometry

    Nielsen, Michael Lund, Bennett, K. L., Larsen, B., Moniatte, M. & Mann, M., 2002, I: Journal of Proteome Research. 1, 1, s. 63-71 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  141. 2001

  142. Advantages of external accumulation for electron capture dissociation in Fourier transform mass spectrometry

    Haselmann, K. F., Budnik, B. A., Olsen, Jesper Velgaard, Nielsen, Michael Lund, Reis, C. A., Clausen, H., Johnsen, A. H. & Zubarev, R. A., 2001, I: Analytical Chemistry. 73, 13, s. 2998-3005 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  143. Comparison of electron capture dissociation and collisionally activated dissociation of polycations of peptide nucleic acids

    Olsen, Jesper Velgaard, Haselmann, K. F., Nielsen, Michael Lund, Budnik, B. A., Nielsen, P. E. & Zubarev, R. A., 2001, I: Rapid Communications in Mass Spectrometry. 15, 12, s. 969-74 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  144. 2000

  145. Intramolecular hydrogen atom transfer in hydrogen-deficient polypeptide radical cations

    Nielsen, Michael Lund, Budnik, B. A., Haselmann, K. F., Olsen, Jesper Velgaard & Zubarev, R. A., 2000, I: Chemical Physics Letters. 330, 5-6, s. 558-562 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  146. Tandem ionization mass spectrometry of biomolecules

    Zubarev, R. A., Nielsen, Michael Lund & Budnik, B. A., 2000, I: European Journal of Mass Spectrometry. 6, 3, s. 235-240 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

ID: 13143239