Søren Brunak

Søren Brunak

Professor


  1. 2021
  2. Udgivet

    Predictive utilities of lipid traits, lipoprotein subfractions and other risk factors for incident diabetes: a machine learning approach in the Diabetes Prevention Program

    Diabetes Prevention Program Research Group, D. P. P. R. G., mar. 2021, I: B M J Open Diabetes Research & Care. 9, 1, 12 s., e001953.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    A genome-wide meta-analysis yields 46 new loci associating with biomarkers of iron homeostasis

    Bell, S., Rigas, A. S., Magnusson, M. K., Ferkingstad, E., Allara, E., Bjornsdottir, G., Ramond, A., Sørensen, E., Halldorsson, G. H., Paul, D. S., Burgdorf, K. S., Eggertsson, H. P., Howson, J. M. M., Thørner, L. W., Kristmundsdottir, S., Astle, W. J., Erikstrup, C., Sigurdsson, J. K., Vuckovic, D., Dinh, K. M. & 31 flere, Tragante, V., Surendran, P., Pedersen, Ole Birger Vesterager, Vidarsson, B., Jiang, T., Paarup, H. M., Onundarson, P. T., Akbari, P., Nielsen, K. R., Lund, S. H., Juliusson, K., Magnusson, M. I., Frigge, M. L., Oddsson, A., Olafsson, I., Kaptoge, S., Hjalgrim, Henrik, Runarsson, G., Wood, A. M., Hansen, Thomas Folkmann, Burgdorf, Kristoffer Sølvsten, Jemec, Gregor, Jennum, Poul, Nielsen, K. R., Petersen, M., Werge, Thomas, Westergaard, David, Banasik, Karina, Brunak, Søren, Ullum, H. & DBDS Genomic Consortium, D. G. C., 2021, I: Communications Biology . 4, 1, 14 s., 156.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Acute and persistent symptoms in non-hospitalized PCR-confirmed COVID-19 patients

    Bliddal, S., Banasik, Karina, Pedersen, Ole Birger Vesterager, Nissen, J., Cantwell, Lisa, Schwinn, M., Tulstrup, Morten Rytter, Westergaard, David, Ullum, H., Brunak, Søren, Tommerup, Niels, Feenstra, B., Geller, F., Ostrowski, Sisse Rye, Grønbæk, Kirsten, Nielsen, Claus Henrik, Nielsen, Susanne Dam & Feldt-Rasmussen, Ulla, 2021, I: Scientific Reports. 11, 13153.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Artificial Intelligence and Early Detection of Pancreatic Cancer: 2020 Summative Review

    Kenner, B., Chari, S. T., Kelsen, D., Klimstra, D. S., Pandol, S. J., Rosenthal, M., Rustgi, A. K., Taylor, J. A., Yala, A., Abul-Husn, N., Andersen, D. K., Bernstein, D., Brunak, S., Canto, M. I., Eldar, Y. C., Fishman, E. K., Fleshman, J., Go, V. L. W., Holt, J. M., Field, B. & 14 flere, Goldberg, A., Hoos, W., Iacobuzio-Donahue, C., Li, D., Lidgard, G., Maitra, A., Matrisian, L. M., Poblete, S., Rothschild, L., Sander, C., Schwartz, L. H., Shalit, U., Srivastava, S. & Wolpin, B., 2021, I: Pancreas. 50, 3, s. 251-279 29 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Association of Variants Near the Bradykinin Receptor B2 Gene With Angioedema in Patients Taking ACE Inhibitors

    Ghouse, Jonas, Ahlberg, G., Andreasen, Laura Korsholm, Banasik, Karina, Brunak, Søren, Schwinn, M., Larsen, I. H., Petersen, O., Sørensen, E., Ullum, H., Rasmussen, E. R., Eriksson, N., Hallberg, P., Wadelius, M., Bundgård, Henning & Olesen, Morten Steen Salling, 2021, I: Journal of the American College of Cardiology. 78, 7, s. 696-709 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Chance of live birth: a nationwide, registry-based cohort study

    Kolte, A. M., Westergaard, David, Lidegaard, Øjvind, Brunak, Søren & Nielsen, Henriette Svarre, 2021, I: Human Reproduction. 36, 4, s. 1065-1073 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Cohort profile: Copenhagen Hospital Biobank - Cardiovascular Disease Cohort (CHB-CVDC): Construction of a large-scale genetic cohort to facilitate a better understanding of heart diseases

    Laursen, I. H., Banasik, K., Haue, A. D., Petersen, O., Holm, P. C., Westergaard, D., Bundgaard, H., Brunak, S., Frikke-Schmidt, R., Holm, H., Sørensen, E., Thorner, L. W., Larsen, M. A. H., Schwinn, M., Køber, L., Torp-Pedersen, C., Ostrowski, S. R., Erikstrup, C., Nyegaard, M., Stefansson, H. & 11 flere, Gylfason, A., Zink, F., Walters, G. B., Oddsson, A., Thorleifsson, G., Masson, G., Thorsteinsdottir, U., Gudbjartsson, D., Pedersen, Ole Birger Vesterager, Stefansson, K. & Ullum, H., 2021, I: BMJ Open. 11, 12, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Data Resource Profile: The Copenhagen Hospital Biobank (CHB)

    Sørensen, E., Christiansen, L., Wilkowski, B., Larsen, M. H., Burgdorf, Kristoffer Sølvsten, Thørner, L. W., Nissen, J., Pedersen, Ole Birger Vesterager, Banasik, Karina, Brunak, Søren, Bundgård, Henning, Stefánsson, H., Stefánsson, K., Melbye, M. & Ullum, H., 2021, I: International Journal of Epidemiology. 50, 3, s. 719-720e

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Detection of Molecular Signatures of Homologous Recombination Deficiency in Bladder Cancer

    Pilmark, Judit Börcsök, Diossy, M., Sztupinszki, Z., Prosz, A., Tisza, V., Spisak, S., Rusz, O., Stormoen, D. R., Pappot, Helle, Csabai, I., Brunak, Søren, Mouw, K. W. & Szallasi, Z., 2021, I: Clinical Cancer Research. 27, 13, 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    ELIXIR-EXCELERATE: establishing Europe's data infrastructure for the life science research of the future

    ELIXIR-EXCELERATE Community, E. C., 2021, I: EMBO Journal. 40, 6, 9 s., e107409.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  12. Udgivet

    Eleven genomic loci affect plasma levels of chronic inflammation marker soluble urokinase-type plasminogen activator receptor

    Dowsett, J., Ferkingstad, E., Rasmussen, L. J. H., Thørner, L. W., Magnússon, M. K., Sugden, K., Thorleifsson, G., Frigge, M., Burgdorf, K. S., Ostrowski, S. R., Sørensen, E., Erikstrup, C., Pedersen, O. B., Hansen, T. F., Banasik, K., Brunak, S., Tragante, V., Lund, S. H., Stefansdottir, L., Gunnarson, B. & 10 flere, Poulton, R., Arseneault, L., Caspi, A., Moffitt, T. E., Gudbjartsson, D., Eugen-Olsen, J., Stefánsson, H., Stefánsson, K., Ullum, H. & DBDS Genomic Consortium, D. G. C., 2021, I: Communications Biology . 4, 1, s. 655

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Endotrophin is associated with chronic multimorbidity and all-cause mortality in a cohort of elderly women

    Staunstrup, L. M., Bager, C. L., Frederiksen, P., Helge, Jørn Wulff, Brunak, Søren, Christiansen, C. & Karsdal, M., 2021, I: EBioMedicine. 68, 10 s., 103391.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Extrapolation of drug induced liver injury responses from cancer cell lines using machine learning approaches

    Aguayo-Orozco, A., Brunak, Søren & Taboureau, O., 2021, I: Computational Toxicology. 17, 6 s., 100147.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Genetic insight into sick sinus syndrome

    Thorolfsdottir, R. B., Sveinbjornsson, G., Aegisdottir, H. M., Benonisdottir, S., Stefansdottir, L., Ivarsdottir, E. V., Halldorsson, G. H., Sigurdsson, J. K., Torp-Pedersen, C., Weeke, P. E., Brunak, S., Westergaard, D., Pedersen, O. B., Sørensen, E., Nielsen, K. R., Burgdorf, K. S., Banasik, K., Brumpton, B., Zhou, W., Oddsson, A. & 25 flere, Tragante, V., Hjorleifsson, K. E., Davidsson, O. B., Rajamani, S., Jonsson, S., Torfason, B., Valgardsson, A. S., Thorgeirsson, G., Frigge, M. L., Thorleifsson, G., Norddahl, G. L., Helgadottir, A., Gretarsdottir, S., Sulem, P., Jonsdottir, I., Willer, C. J., Hveem, K., Bundgård, Henning, Ullum, H., Arnar, D. O., Thorsteinsdottir, U., Gudbjartsson, D. F., Holm, H., Stefansson, K. & DBDS Genomic Consortium, D. G. C., 2021, I: European Heart Journal. 42, 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Genome-wide analysis of 944 133 individuals provides insights into the etiology of haemorrhoidal disease

    Zheng, T., Ellinghaus, D., Juzenas, S., Cossais, F., Burmeister, G., Mayr, G., Jørgensen, I. F., Teder-Laving, M., Skogholt, A. H., Chen, S., Strege, P. R., Ito, G., Banasik, K., Becker, T., Bokelmann, F., Brunak, S., Buch, S., Clausnitzer, H., Datz, C., Degenhardt, F. & 31 flere, Doniec, M., Erikstrup, C., Esko, T., Forster, M., Frey, N., Fritsche, L. G., Gabrielsen, M. E., Gräßle, T., Gsur, A., Gross, J., Hampe, J., Hendricks, A., Hinz, S., Hveem, K., Jongen, J., Junker, R., Karlsen, T. H., Hemmrich-Stanisak, G., Kruis, W., Kupcinskas, J., Laubert, T., Rosenstiel, P. C., Röcken, C., Laudes, M., Leendertz, F. H., Lieb, W., Limperger, V., Pedersen, Ole Birger Vesterager, Rodriguez, C. L., Ullum, H. & DBDS Consortium, D. C., 2021, I: Gut. 70, 8, s. 1538-1549

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Identification of a Synthetic Lethal Relationship between Nucleotide Excision Repair Deficiency and Irofulven Sensitivity in Urothelial Cancer

    Börcsök, J., Sztupinszki, Z., Bekele, R., Gao, S. P., Diossy, M., Samant, A. S., Dillon, K. M., Tisza, V., Spisák, S., Rusz, O., Csabai, I., Pappot, H., Frazier, Z. J., Konieczkowski, D. J., Liu, D., Vasani, N., Rodrigues, J. A., Solit, D. B., Hoffman-Censits, J. H., Plimack, E. R. & 10 flere, Rosenberg, J. E., Lazaro, J., Taplin, M., Iyer, G., Brunak, Søren, Lozsa, R., Van Allen, E. M., Szüts, D., Mouw, K. W. & Szallasi, Z., 2021, I: Clinical Cancer Research. 27, 7, s. 2011-2022 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Identifying patients at high risk of inappropriate drug dosing in periods with renal dysfunction

    Kaas-Hansen, Benjamin Skov, Rodriguez, C. L., Placido, Davide, Thorsen-Meyer, H., Nielsen, A. P., Dérian, N., Brunak, Søren & Andersen, Stig Ejdrup, 2021, medRxiv.

    Publikation: Working paperPreprint

  19. Udgivet

    Impaired Vitamin D Signaling in T Cells From a Family With Hereditary Vitamin D Resistant Rickets

    Al-Jaberi, F. A. H., Kongsbak-Wismann, Martin, Aguayo-Orozco, A., Krogh, Nicolai, Buus, Terkild Brink, Lopez, D. V., Rode, A. K. O., Gravesen, Eva, Ølgaard, Klaus, Brunak, Søren, Woetmann, Anders , Ødum, Niels, Bonefeld, Charlotte Menne & Geisler, Carsten, 2021, I: Frontiers in Immunology. 12, 11 s., 684015.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Integrating Longitudinal Clinical and Baseline Multiomics Data for Predicting C-Peptide Progression in Newly Diagnosed Type 1 Diabetes: 1111-P

    Brorsson, C., Armenteros, J. J. A., Mazzoni, G., Kaur, S., Schulte, A. M., Mathieu, C. & Brunak, Søren, 2021. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  21. Udgivet

    Mapping the human genetic architecture of COVID-19

    Niemi, M. E. K., Karjalainen, J., Liao, R. G., Neale, B. M., Daly, M., Ganna, A., Pathak, G. A., Andrews, S. J., Kanai, M., Veerapen, K., Fernandez-Cadenas, I., Schulte, E. C., Striano, P., Marttila, M., Minica, C., Marouli, E., Karim, M. A., Wendt, F. R., Savage, J., Sloofman, L. & 41 flere, Butler-Laporte, G., Kim, H., Kanoni, S., Okada, Y., Byun, J., Han, Y., Uddin, M. J., Smith, G. D., Willer, C. J., Buxbaum, J. D., Karjalainen, J., Mehtonen, J., Folkersen, L., Moltke, Ida, Hinney, A., Wang, C., Ellinghaus, D., Brunak, Søren, Castro, P., Guindo Martínez, Marta, Lee, J. Y., Loos, Ruth, Zhao, J. H., Sun, Y. V., Wang, B., Parker, R., Garcia, S. M., Smith, O., Davis, C., COVID-19 Host Genetics Initiative, C. H. G. I., 23andMe COVID-19 Team, 2. C. T., Norwegian SARS-CoV-2 Study Grp, N. S. S. G., Humanitas COVID-19 Task Force, H. C. T. F., Humanitas Gavazzeni COVID-19 Task, H. G. C. T., FHoGID, F., RegCOVID, R., P-PredictUs, P., SeroCOVID, S., CRiPSI, C., Genes & Hlth Res Team, G. &. H. R. T. & UCLA Hlth ATLAS Data Mart Working, U. H. A. D. M. W., 2021, I: Nature. 600, s. 472-477

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Optimizing drug selection from a prescription trajectory of one patient

    Aguayo-Orozco, A., Haue, Amalie Dahl, Jørgensen, Isabella Friis, Westergaard, David, Moseley, P. L., Mortensen, Laust Hvas & Brunak, Søren, 2021, I: npj Digital Medicine. 4, 1, 150.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Processes Underlying Glycemic Deterioration in Type 2 Diabetes: An IMI DIRECT Study

    Bizzotto, R., Jennison, C., Jones, A. G., Kurbasic, A., Tura, A., Kennedy, G., Bell, J. D., Thomas, E. L., Frost, G., Eriksen, R., Koivula, R. W., Brage, S., Kaye, J., Hattersley, A. T., Heggie, A., McEvoy, D., 't Hart, L. M., Beulens, J. W., Elders, P., Musholt, P. B. & 28 flere, Ridderstrale, M., Hansen, T. H., Allin, K. H., Hansen, Torben, drb459, drb459, Lundgaard, Agnete Troen, Thomsen, Henrik S., De Masi, F., Tsirigos, Konstantinos, Brunak, Søren, Vinuela, A., Mahajan, A., McDonald, T. J., Kokkola, T., Forgie, I. M., Giordano, G. N., Pavo, I., Ruetten, H., Dermitzakis, E., McCarthy, M. I., Pedersen, Oluf Borbye, Schwenk, J. M., Adamski, J., Franks, P. W., Walker, M., Pearson, E. R., Mari, A. & IMI-DIRECT consortium, I. C., 2021, I: Diabetes Care. 44, 2, s. 511-518 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Profiles of glucose metabolism in different prediabetes phenotypes, classified by fasting glycemia, 2-hour OGTT, glycated hemoglobin, and 1-hour OGTT: An IMI DIRECT study

    Tura, A., Grespan, E., Göbl, C. S., Koivula, R. W., Franks, P. W., Pearson, E. R., Walker, M., Forgie, I. M., Giordano, G. N., Pavo, I., Ruetten, H., Dermitzakis, E. T., McCarthy, M. I., Pedersen, O., Schwenk, J. M., Adamski, J., De Masi, F., Tsirigos, K. D., Brunak, S., Viñuela, A. & 17 flere, Mahajan, A., McDonald, T. J., Kokkola, T., Vangipurapu, J., Cederberg, H., Laakso, M., Rutters, F., Elders, P. J. M., Koopman, A. D. M., Beulens, J. W., Ridderstråle, M., Hansen, T. H., Allin, K. H., Hansen, Torben, drb459, drb459, Mari, A. & IMI-DIRECT consortium, I. C., 2021, I: Diabetes. 70, 6, db210227.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Semen quality and waiting time to pregnancy explored using association mining

    Romero Herrera, J. A., Bang, A. K., Priskorn, L., Izarzugaza, J. M. G., Brunak, Søren & Jørgensen, N., 2021, I: Andrology. 9, 2, s. 577-587 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    The burden of disease of three food-associated heavy metals in clusters in the Danish population - Towards targeted public health strategies

    Herrera, J. A. R., Thomsen, S. T., Jakobsen, L. S., Fagt, S., Banasik, Karina, Izarzugaza, J. M. G., Brunak, Søren & Pires, S. M., 2021, I: Food and Chemical Toxicology. 150, 112072.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    The impact of early pregnancy complications on completed family size—A nationwide, registry-based cohort study with 40 years of data

    Kolte, A. M., Westergaard, David, Lidegaard, Øjvind, Brunak, Søren & Nielsen, Henriette Svarre, 2021, I: Acta Obstetricia et Gynecologica Scandinavica. 100, 12, s. 2226-2233

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Time-ordered comorbidity correlations identify patients at risk of mis- and overdiagnosis

    Jørgensen, Isabella Friis & Brunak, Søren, 2021, I: npj Digital Medicine. 4, 10 s., 12.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Understanding inherent image features in CNN-based assessment of diabetic retinopathy

    Reguant, R., Brunak, Søren & Saha, S., 2021, I: Scientific Reports. 11, 12 s., 9704.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 12895347